С помощью краскопульта под давлением залить в трещины антисептик и забыть о проблеме. На даче стоит сруб бани много лет. Ничем не обработан, трещины есть, совершенно не напрягают. Ничего с ними не происходит. Сгнил только нижний венец, который практически на земле лежит, т.к. столбики фундамента со временем совсем в грунт погрузились. По наблюдениям, дерево, имеется в виду сосна, не любит постоянной влаги. Если бревно лежит на земле, то оно будет гнить. Если оно находится на воздухе, проветривается, то ничего с ним не случится, несмотря на все трещины и другие дефекты. У срубов чаще всего гниют нижние венцы от влаги из земли, и верхние, если крыша худая. За остальное можно не переживать.