Раньше как-то не задумывался об этом, всегда ставил райд на всё устройство и никогда ещё не сталкивался с отказами, а теперь пришла мысль, что лет через пять будет проблемно найти винт 1в1 если один из дисков подохнет. Т.е. лучше всё-таки создавать раздел и в него уже пихать рейд?

Рейд подразумевается программный.